MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 6289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013851	GGT	2	6	1294324	1294329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_013851	GCC	2	6	1294343	1294348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_013851	AGG	2	6	1294554	1294559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_013851	AGG	2	6	1295849	1295854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_013851	CGG	2	6	1295896	1295901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_013851	CCG	2	6	1295915	1295920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2507	NC_013851	CGC	2	6	1296023	1296028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_013851	CGT	2	6	1296033	1296038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_013851	CGG	2	6	1296103	1296108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_013851	TCCC	2	8	1296129	1296136	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2511	NC_013851	GGA	2	6	1296162	1296167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_013851	GA	4	8	1297022	1297029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_013851	CCG	2	6	1299431	1299436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_013851	T	7	7	1299446	1299452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_013851	CGAT	2	8	1300763	1300770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2516	NC_013851	CTC	2	6	1300779	1300784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2517	NC_013851	CCT	2	6	1300789	1300794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_013851	AACG	2	8	1302328	1302335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2519	NC_013851	ATC	2	6	1302373	1302378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2522	NC_013851	GAGGC	2	10	1305559	1305568	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2523	NC_013851	CGC	2	6	1310242	1310247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2524	NC_013851	CGG	2	6	1310284	1310289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_013851	CTC	2	6	1314268	1314273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2526	NC_013851	CGA	2	6	1314275	1314280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_013851	GC	3	6	1314301	1314306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2528	NC_013851	GAG	2	6	1314310	1314315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_013851	CGG	2	6	1314327	1314332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_013851	TCGA	2	8	1314493	1314500	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2531	NC_013851	GGA	2	6	1318400	1318405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_013851	ATC	2	6	1318411	1318416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_013851	GCC	2	6	1319099	1319104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2534	NC_013851	GTC	2	6	1319507	1319512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_013851	GCCT	2	8	1319524	1319531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2536	NC_013851	GCC	2	6	1319544	1319549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2537	NC_013851	ACC	2	6	1319575	1319580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2538	NC_013851	CCA	2	6	1319603	1319608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_013851	AG	3	6	1319660	1319665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_013851	GGAA	2	8	1319697	1319704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_013851	CG	3	6	1319749	1319754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2542	NC_013851	GGAA	2	8	1319835	1319842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_013851	GAA	2	6	1320437	1320442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_013851	GCC	2	6	1320498	1320503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_013851	CTGTTG	2	12	1320896	1320907	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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2548	NC_013851	CCAT	2	8	1321096	1321103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2549	NC_013851	TCG	2	6	1321673	1321678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_013851	TCAT	2	8	1321710	1321717	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2551	NC_013851	GCG	2	6	1321734	1321739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_013851	CCA	2	6	1322142	1322147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2553	NC_013851	CCGG	2	8	1324408	1324415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2554	NC_013851	GC	3	6	1324449	1324454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2555	NC_013851	CAG	2	6	1324519	1324524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2557	NC_013851	GT	3	6	1325325	1325330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_013851	GAA	2	6	1325334	1325339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_013851	CGGA	2	8	1325340	1325347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2560	NC_013851	GATG	2	8	1325361	1325368	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_013851	CA	3	6	1325418	1325423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2562	NC_013851	GC	3	6	1325449	1325454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2563	NC_013851	TG	3	6	1325471	1325476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_013851	CTC	2	6	1326032	1326037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2566	NC_013851	AATCC	2	10	1327175	1327184	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2567	NC_013851	ATC	2	6	1337012	1337017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_013851	ATA	2	6	1337496	1337501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_013851	CGCT	2	8	1337551	1337558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2570	NC_013851	CTT	2	6	1337707	1337712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_013851	GAAT	2	8	1339479	1339486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_013851	TCG	2	6	1345555	1345560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_013851	CGGA	2	8	1345601	1345608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2574	NC_013851	TCG	2	6	1345699	1345704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2579	NC_013851	GCC	2	6	1345858	1345863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2580	NC_013851	CTT	2	6	1345960	1345965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2583	NC_013851	CGG	2	6	1345992	1345997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2587	NC_013851	GTGCC	2	10	1347390	1347399	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2588	NC_013851	TCGA	2	8	1347409	1347416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2589	NC_013851	CG	3	6	1347432	1347437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2597	NC_013851	TG	3	6	1355212	1355217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_013851	TCC	2	6	1355344	1355349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2599	NC_013851	TCA	2	6	1355403	1355408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2601	NC_013851	CCG	2	6	1356366	1356371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2603	NC_013851	GCC	2	6	1356417	1356422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_013851	GAG	2	6	1361414	1361419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2606	NC_013851	GC	3	6	1361580	1361585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2607	NC_013851	GAGG	2	8	1363034	1363041	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_013851	TGA	2	6	1363085	1363090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_013851	GA	3	6	1364837	1364842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_013851	TC	3	6	1366303	1366308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2611	NC_013851	CCAG	2	8	1366335	1366342	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2612	NC_013851	ATGG	2	8	1367287	1367294	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_013851	CGG	2	6	1367324	1367329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_013851	GCG	2	6	1369541	1369546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_013851	GC	4	8	1369556	1369563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2616	NC_013851	GC	3	6	1369565	1369570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2621	NC_013851	GC	3	6	1369760	1369765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2622	NC_013851	GCTCGC	2	12	1369777	1369788	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2623	NC_013851	AC	3	6	1369811	1369816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2624	NC_013851	CGC	2	6	1369838	1369843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2625	NC_013851	CGC	2	6	1372693	1372698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2627	NC_013851	GGC	2	6	1372769	1372774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_013851	CCA	2	6	1372862	1372867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2629	NC_013851	GCAGG	2	10	1372905	1372914	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2630	NC_013851	ATGCG	2	10	1374350	1374359	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2631	NC_013851	ATGC	2	8	1374364	1374371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2632	NC_013851	CAAT	2	8	1374376	1374383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2633	NC_013851	GCA	2	6	1375670	1375675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_013851	GGC	2	6	1375677	1375682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2635	NC_013851	G	6	6	1375714	1375719	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_013851	TG	3	6	1375745	1375750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2637	NC_013851	G	8	8	1375777	1375784	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2638	NC_013851	GCT	2	6	1375893	1375898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2643	NC_013851	ATA	2	6	1377037	1377042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2646	NC_013851	CTGGA	2	10	1381618	1381627	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2647	NC_013851	GGAT	2	8	1382881	1382888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2655	NC_013851	GGA	2	6	1386139	1386144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2663	NC_013851	CAGC	2	8	1388981	1388988	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2664	NC_013851	CTCG	2	8	1390129	1390136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2665	NC_013851	CG	3	6	1391104	1391109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2666	NC_013851	GCCG	2	8	1391110	1391117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2667	NC_013851	T	6	6	1391163	1391168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2669	NC_013851	GCCG	2	8	1391190	1391197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2674	NC_013851	AAG	2	6	1391982	1391987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2747	NC_013851	CGAGG	2	10	1449598	1449607	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2748	NC_013851	GC	3	6	1452255	1452260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2749	NC_013851	GAA	2	6	1454894	1454899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2750	NC_013851	AATCG	2	10	1455012	1455021	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2751	NC_013851	GCTC	2	8	1455028	1455035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2752	NC_013851	CAGT	2	8	1457077	1457084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2753	NC_013851	CGCT	2	8	1457119	1457126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2754	NC_013851	GCT	2	6	1457179	1457184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2756	NC_013851	CTTG	2	8	1465869	1465876	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2757	NC_013851	GGC	2	6	1465890	1465895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2758	NC_013851	CGGT	2	8	1465927	1465934	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2759	NC_013851	GGC	2	6	1468361	1468366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2760	NC_013851	GGTCC	2	10	1468368	1468377	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2761	NC_013851	GCG	2	6	1468443	1468448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2762	NC_013851	CGATT	2	10	1468548	1468557	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2763	NC_013851	GTC	2	6	1469531	1469536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2766	NC_013851	CAGC	2	8	1470741	1470748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2796	NC_013851	TCG	2	6	1486893	1486898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2798	NC_013851	GCT	3	9	1486957	1486965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2897	NC_013851	GCAC	2	8	1553198	1553205	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2898	NC_013851	GAT	2	6	1553207	1553212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2899	NC_013851	GTC	2	6	1553237	1553242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2900	NC_013851	CCCGCG	2	12	1556011	1556022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2901	NC_013851	G	6	6	1559930	1559935	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2994	NC_013851	CT	3	6	1614112	1614117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2995	NC_013851	GAG	2	6	1614125	1614130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2997	NC_013851	CCG	2	6	1616271	1616276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2998	NC_013851	CCGA	2	8	1616291	1616298	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2999	NC_013851	CGC	2	6	1616316	1616321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3000	NC_013851	GC	3	6	1616386	1616391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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